回到中原以后，薛仁贵被委以重任，统领宫廷禁卫军被派驻扎玄武门

　　看守玄武十二年，危难忠胆救高宗　当然，回到中原以后，薛仁贵被委以重任，统领宫廷禁卫军被派驻扎玄武门，宫廷禁卫军虽不是职位特别高的官，但那是守卫皇帝的安全工作，是很拉风，很酷，而且很重要的职位，一个农民出身的士兵而且没有任何家庭背景和人际关系的人，可以被皇帝这样信任，足可见其忠义与实力，加上那是唐太宗得天下的门，也能看出意义非凡，这个“守天下之门”日后他也做到了．就这样没什么战事，薛仁贵守了１２年半的玄武门，途中千古一帝唐太宗也去世了，纵观薛仁贵起家，是唐太宗亲自发现了这块埋在土里的金子，但是真正给了他叱咤风云的军事舞台的人是唐太宗的儿子，雄韬大略的唐高宗。唐高宗永徽五年（６５４），闰五月初三夜，天降大雨，山洪爆发。水冲至玄武门，保护皇帝的人大多都已逃命去了，薛仁贵很愤怒，说：“安有天子有急，辄敢惧死？”然后薛仁贵冒死登门框向皇宫大呼以救高宗。高宗感其恩，说：“赖得卿呼，方免沦溺，始知有忠臣也。”多亏靠了你，我才没有被水溺死，我才知道这世上有忠臣啊。并特赐御马一匹。根据记载，这次山洪附近死了几千人。幸好薛仁贵在，否则中国历史可能就该改变了。唐高宗非常感谢薛仁贵，以至于日后多次提起这事，这件功劳也许大家认为不是什么开疆扩土的大功，但是皇帝认为这功很大，毕竟是救了自己一命，从此薛仁贵的人生上了一个新台阶。 　　将军已然不惑年，率强兵平四方　显庆二年闰月（６５７），右屯卫将军苏定方进军西突厥 ，薛仁贵虽然没参加，但献出了最重要的政治决策，为苏定方灭西突厥做出了重要贡献．薛仁贵上书说“臣闻兵出无名，事故不成，明其为贼，敌乃可伏。今泥熟仗素干，不伏贺鲁，为贼所破，虏其妻子。汉兵有于贺鲁诸部落得泥熟等家口，将充贱者，宜括取送还，仍加赐赉。即是矜其枉破，使百姓知贺鲁是贼，知陛下德泽广及也。”意思就是出师有名，收买人心。苏定方，大唐名将，是李靖的嫡传弟子，李靖兵法的继承人，比薛仁贵年长２０多岁，这样一位大将能接受薛仁贵这一个看门将军的意见，可见他对薛仁贵军事才华的尊重。苏定方最后成功的开拓西域也得益于薛仁贵的计策。显庆三年（６５８），已经４４岁的薛仁贵，终于开始自己统帅军队，开始了自己那传奇的军事指挥官生涯（唐朝将领多数都是人到中年才开始统领军队）。显庆三年（６５８），薛仁贵和营州都督兼东夷都护程名振骚扰高丽，薛仁贵率众一举攻克赤烽镇，斩首４００人，俘虏１００余人。同年６月，高丽派遣大将豆方娄率军３万人迎战唐军，被薛仁贵击败，斩首３０００级。显庆四年（６５９），薛仁贵率军与高丽大将温沙门大战于横山（今辽阳华表山），薛仁贵匹马当先。高丽军无法抵挡，大败而逃。已经是军队的统帅，还能身先士卒，足见勇猛与胆气。同月唐军又与高丽军战于石城，薛仁贵单骑冲阵活捉高丽一神箭手。此战开时，高丽一神箭手，连续射杀唐军１０余人，此时薛仁贵怒发冲冠，并没有用他最擅长的射箭与对方对垒，而直马冲过去，那箭手射箭皆被薛仁贵躲开，近其身，将那神箭手活捉而回。同年１２月，薛仁贵与辛文陵在黑山击败契丹。擒契丹王阿卜固及诸首领，押送东都洛阳。薛仁贵因功升任左武卫将军，封为河东县男。 生擒的那叫契丹王是薛仁贵生擒的第一位政权君主，瞧好了，后面还有几个“大王”被薛仁贵给活捉了。　　马上薛仁贵要开始进行他那下一段奇幻传奇了。 　　将军三箭定天山，战士长歌入汉关　龙朔元年（６６１），铁勒进犯唐边。薛仁贵为铁勒道行军副大总管。出发前唐高宗宴请将士，席间唐高宗对薛仁贵说；“古善射有穿七札者，卿试以五甲射焉。”薛仁贵应命，置甲取弓箭射去，只听弓弦响过，箭已穿五甲而过。唐高宗大吃一惊，又不好意思，当即命人取更加坚固的铠甲赏赐薛仁贵。　　龙朔二年（６６２） ，回纥铁勒九姓突厥（九个部落联盟）得知唐军将至，便聚兵１０余万人，凭借天山（今蒙古杭爱山）有利地形，阻击唐军。当年三月初一，唐军与铁勒交战于天山，铁勒派几十员大将前来挑战，薛仁贵应声出战，独挑几十人，连发三箭，敌人３员将领缀马而亡，敌大军见之，立即混乱，薛仁贵指挥大军趁势掩杀，遂不时，敌人大军投降．因为铁勒骚扰唐边境达数十年之久，薛仁贵命令将投降兵就地活埋，以除后患，蒙古航爱山现在还有坑杀遗迹．但是作为一名大将军应该没有权利坑杀这么多的人，这是和唐朝的民族政策相背离的，所以这应该是朝廷的指令。之后继续北进，将铁勒九部的首领伪叶护三兄弟生擒（第二次生擒政权君主了），从此回纥九姓突厥衰落．当时世间流传歌谣“将军三箭定天山，战士长歌入汉关。”想想这仗打的多漂亮啊，战争本来是艰苦，残忍的事情，士兵能唱着歌回家，表达了军民将士们的喜悦之情。　　这次战役，仁贵虽然立了大功，但主将郑仁泰的犯了错误，导致了这次战争不完美。铁勒的思结、多览葛等部落本来要投降，郑仁泰不结纳，反而出兵捕获了对方的家属，赏赐给部下，这些部落只好逃亡。郑仁泰派兵追赶，不但没有找到敌军，还因为缺乏粮草，损失了许多兵员。薛仁贵自己也娶了一个妾。一回到朝廷，部队的许多将领都遭到朝臣的弹劾，唐高宗以功抵过，未加追究。　　天山之战本来可以一举消灭铁勒，开拓唐朝北方边疆，从而遏制东突厥势力的发展，但由于主将郑仁泰的严重政治性错误使得此战前功尽弃。但薛仁贵三箭定天山使得对唐边境威胁达数十年的铁勒族在不到一个月就马上衰败，可以说是古代将军唯一一位。接着就是薛仁贵自己指挥才能大发挥的舞台了，高丽灭国之战。